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sds在dna提取中的作用(sds提取dna注意事项)

更新:2022-10-31 20:45编辑:bebe归类:中医养生人气:97

sds提取dna注意事项

原理就是去掉植物细胞壁萊垍頭條

细胞膜垍頭條萊

质体萊垍頭條

线粒体萊垍頭條

叶绿体萊垍頭條

剩下细胞核了。就是DNA了。條萊垍頭

通常采用机械研磨的方法破碎植物的组织和细胞,由于植物细胞匀浆含有多种酶类(尤其是氧化酶类)对DNA的抽提产生不利的影响,在抽提缓冲液中需加入抗氧化剂或强还原剂(如巯基乙醇)以降低这些酶类的活性。在液氮中研磨,材料易于破碎,并减少研磨过程中各种酶类的作用。萊垍頭條

十二烷基肌酸钠(sarkosyl)、十六烷基三甲基溴化铵(hexadyltrimethyl垍頭條萊

ammomum條萊垍頭

bromide,简称为CTAB)、十二烷基硫酸钠(sodium萊垍頭條

dodecyl萊垍頭條

sulfate,简称SDS)等离子型表面活性剂,能溶解细胞膜和核膜蛋白,使核蛋白解聚,从而使DNA得以游离出来。再加入苯酚和氯仿等有机溶剂,能使蛋白质变性,并使抽提液分相,因核酸(DNA、RNA)水溶性很强,经离心后即可从抽提液中除去细胞碎片和大部分蛋白质。上清液中加入无水乙醇使DNA沉淀,沉淀DNA溶于TE溶液中,即得植物总DNA溶液垍頭條萊

sds方法提取DNA各个试剂作用

药品试剂及耗材: —— 液氮 —— 提取缓 冲液:500 mmol/L NaCl, 100 mmol/L Tris-HCl ph8, 50 mmol/L EDTA ph8,10 mmol/L 2-巯基乙醇(用前加入) ---- 20% SDS ph7.2 ---- 5 mol/L KAc ---- 氯仿:异戊醇(24:1) —— 异丙醇 —— 70%乙醇 —— TE缓冲液 :10 mmol/L Tris-HCl,1 mmol/L EDTA,PH8.0萊垍頭條

sds法提取质粒dna原理

  质粒DNA提取一般用沸水浴法和碱裂解法,现在一般都采用碱裂解法,并有试剂盒可用。它主要是将细胞内的环状质粒提取出来,一般需要用SDS裂解,RNA酶降解,然后过柱,再进行洗脱.过程比较简单。  而基因组DNA提取则较为复杂,也需要用SDS裂解和RND酶降解,但降解时间较长,同时对有些革兰氏阳性细菌还要进行溶菌酶处理,最后用氯仿-苯酚进行除蛋白,这一步重复进行多次,在用氯仿除去多余的苯酚,用乙醇清洗烘干后溶于TE缓冲液中。整个过程比提质粒更复杂,耗时也更长。 頭條萊垍

核酸提取sds的作用

SDS(十二烷基苯磺酸钠)是一种阴离子去垢剂,在高温条件下能裂解细胞,使染色体离析、蛋白变性,同时SDS与蛋白质和多糖结合成复合物,释放出核酸。

SDS法提DNA

实验原理1. 离心柱结构:特殊硅基质吸附材料,特异性吸附DNA,而RNA与蛋白质穿过。

在正常情况下,核酸表面覆盖了一层由水分子组成的亲水薄膜,以维持其水溶性。高浓度盐离子的加入破坏了核酸表面亲水薄膜的相对有序排列,形成了疏水环境。在此环境中,核酸与硅胶膜能有效结合,而蛋白质、代谢产物和其他污染物则不能结合。萊垍頭條

2. 碱变性抽提的原理是在pH高于12.6的碱性条件下,染色体DNA的氢键断裂,破坏了碱基配对,导致双螺旋结构解开而变性,但闭环的质粒DNA链由于处于拓扑缠绕状态而不能彼此分开。当pH调至中性时,质粒DNA链迅速恢复到原来构型,仍保存于溶液中。而变性的染色体DNA不能再复性,通过离心,随不稳定的大分子RNA、蛋白质-SDS复合物等一起沉淀下来,使两者得以分离萊垍頭條

sds dna提取

杂质:多酚类、糖类物质较多去除方法:材料粉碎后,在加细胞裂解液前,加入一些缓冲液清洗来除去多糖:缓冲液配比(100mmol/LTris-HCl,pH8.0;100mmol/LEDTA;250mmol/LNaCl;50ug/mL蛋白酶K;1%月桂酸钠Nalauroylsarcosine),50度保温过<Rozman和Komel,1994>,或者只用100mmol/LTris-HCl溶液清洗<李晓波等,2002>。去除多酚成分,可以添加Vc等抗氧化剂(参考浓度30~60mmol/L)<胡春根等,1998>和PVP、PEG等酚的结合剂,防止酚类与DNA的结合。 萊垍頭條

sds法提取植物dna失败的原因

原理:條萊垍頭

要进行重组DNA 实验,就离不开外源基因的纯化,而外源基因主要来源之一就要直接从生物的染色体DNA上制备,所以制备高质量的染色体DNA样品经常为基因工程实验所需要,抽提细菌染色体DNA的方法目前已有许多种,这里所介绍的两种方法:一适用于枯杆菌染色体的抽提;另一种方法则适用于大肠杆菌染色体的制备.萊垍頭條

基因工程实验所需要的基因组DNA 通常要求分子量尽可能大,以此增加外源基因获得率,但要获得大片段的DNA 非易事,细菌基因组DNA通常是个很大的环状态DNA,而在抽提过程中,不可避免的机械剪切力必将切断DNA,如果要抽提到大的DNA 分子,就要尽可能地温和操作,减少剪切力,减少切断DNA 分子的可能性;分子热运动也会减少所抽提到的DNA分子量,所以提取过程也要尽可能在低温下进行.另外细胞内及抽提器皿中污染的核酸酶也会降解制备过程中的DNA,所以制备过程要抑制其核酸酶的活性.萊垍頭條

另外制备的细菌染色体DNA 必须是高纯度的,以满足基因工程中各种酶反应的需要,制备的样品必须没有蛋白污染,没有RNA,各种离子浓度应符合要求,这些在染色体制备时都应考虑到.條萊垍頭

大肠杆菌染色体DNA 抽提首先收集对数生长期的细胞,然后用离子型表面活性剂十二烷基磺酸钠(SDS)破裂细胞,SDS 具有的主要功能是:(1)溶解细胞膜上的脂类和蛋白质,因而溶解膜蛋白而破坏细胞膜;(2)解聚细胞膜上的脂类和蛋白质,有助于消除染色体DNA上的蛋白质;(3)SDS 能与蛋白质结合成为R1—0—SO3R2—蛋白质的复合物,使蛋白质变性而沉淀下来.但是SDS 能抑制核糖核酸酶的作用,所以在以后的提取过程中,必须把它除干净.以免影响下一步RNase的作用.破细胞后RNA经RNase消化除去,蛋白质经苯酚、氯仿:异戊醇抽提除去经洒精沉淀回收DNA.枯草杆菌染色体制备与上类似,但略加修改的方法要适合教学要求.枯草杆菌是格兰氏阳性菌,所以在SDS 处理前需要使用溶菌酶裂解细胞壁.溶菌酶是一种糖苷水解酶,它能水解菌体细胞壁的主要化学成份肽聚糖中的β—1,4 糖苷键,有助于细胞壁破裂,破裂的细胞壁在SDS 的作用下溶菌,同时用蛋白酶K 消化蛋白质,能解离缠绕在染色体DNA上的蛋白质,然后加入一定量的醋酸钾,使蛋白质变性,通常离心除去,在这期间可加入核糖酸酶消化RNA,最后用乙醇回收DNA.萊垍頭條

此二种方法抽提的细菌染色体DNA,无RNA和蛋白质污染,可用于限制性内切酶消化,分子再克隆等.但在下一步实验前,要测定其DNA的浓度,常用测定DNA 浓度的方法,是溴化乙锭电泳法;当DNA 样品在琼脂糖凝胶中电泳时,加入的EB 会增强发射的荧光.而荧光的强度正比于DNA 的含量,如将已知浓度的标准样品作电泳对照,就可估计出待样品的浓度。萊垍頭條

sds在提取DNA作用机理

植物DNA的提取萊垍頭條

1、目的要求垍頭條萊

学习从新鲜的叶片中提取植物总DNA的方法。萊垍頭條

2、实验原理萊垍頭條

本实验介绍的就是一种快速简便提取植物总DNA的方法:先将新鲜的叶片在液氨中研磨,以机械力破碎细胞壁,然后加入十六烷三甲基溴化铵(简称CBA,是一种阳离子去污剂)分离缓冲液,使细胞膜破裂,同时将核酸与植物多糖等杂质分开。再经氯仿-异戊醇提取去除蛋白,即可得到适合于酶切的DNA。垍頭條萊

3、试剂和器材萊垍頭條

一、试剂條萊垍頭

CTBA抽提缓冲液:2%CTBA.100mmolL Tris-HCl,pH8.0;20mmolL EDTA;1.4molL萊垍頭條

NaCl;0.2%(vv)巯基乙醇共100mL:称取2 g CTBA,8.18 g NaCI,0.74 g EDTA Na22H20,加入10mL1molL的Tris-HCl,pH8.0,0.2mL的巯基乙醇,加水定容至100mL.萊垍頭條

TE:TrisEDTA缓冲液:10mmolL Tris-HCl,pH8.0;1mmolL EDTA。萊垍頭條

异丙醇:乙醇:氯仿一异戊醇(24:1,V:V):液氮。萊垍頭條

二、材料萊垍頭條

新鲜植物叶片。頭條萊垍

三、材萊垍頭條

研钵:离心机:恒温水浴。垍頭條萊

4、操作方法萊垍頭條

1.称取lg新鲜叶片,置于预冷的研钵中,倒入液氮,将叶片研至粉末。條萊垍頭

2.将叶片粉末转入一个30mL离心管中。萊垍頭條

3。加10 mL CTBA抽提缓冲液,轻轻转动离心管使之混匀。于65℃温育10min。加入等体积的氯仿一异戊醇,轻轻颠倒混匀。垍頭條萊

4.室温下4000rmin离心10min,回收上层水相。在回收的上层水相中。頭條萊垍

5。加入23体积预冷的异丙醇(预冷至一20℃),轻轻混匀,置冰箱中放置数小时梦至过夜,使核酸沉淀下来。萊垍頭條

6.室温下4000rmin离心10min。萊垍頭條

7.小心倒去上清液,用80%乙醇洗涤沉淀物.尽量沥干乙醇,置于真空干燥器内干称重,计算产率。萊垍頭條

8.将DNA沉淀溶于1mLTE中。萊垍頭條

sds法提取dna注意事项

DNA的提取方法萊垍頭條

一.酚抽提法:先用蛋酶K、SDS破碎细胞,消化蛋白,然后用酚和酚-氯DNA大小为100-150kb萊垍頭條

二.甲酰胺解聚法:破碎细胞同上,然后用高浓度甲酰胺解聚蛋白质与DNA的结合,再透析获得DNA可得DNA200kb左右。萊垍頭條

三.玻璃棒缠绕法:用盐酸胍裂解细胞,将裂解物铺于乙醇上,然后用带钩或U型玻璃棒在界面轻搅,DNA沉淀液绕于玻棒。生成DNA约80kb。萊垍頭條

四.异丙醇沉淀法:基本同1法,仅用二倍容积异丙醇替代乙醇,可去除小分子RNA(在异丙醇中可溶状态)條萊垍頭

五.表面活性剂快速制备法:用Triton X-100A或NP40表面活性剂破碎细胞,然后用蛋白酶K或酚去除蛋白,乙醇沉淀或透析。條萊垍頭

六.加热法快速制备:加热96℃-100℃,五分钟,然后离心后取上清,可用于PCR反应。頭條萊垍

七.碱变性快速制备:先用NaOH作用20分钟,再加HCI中和,离心后取上清,含少量DNA。萊垍頭條

sds法提取蛋白质

DNA提取的几种方法

(1).浓盐法

利用RNP和DNP在电解溶液中溶解度不同,将二者分离,常用的方法是用1M 氯 纳提取化钠抽提,得到的DNP粘液与含有少量辛醇的 氯仿一起摇荡,使乳化,再离心除去蛋白质,此时蛋白质凝胶停留在水相及氯仿相中间,而DNA位于上层水相中,用2倍体积95%乙醇可将DNA 钠盐沉淀出来.

也可用0.15 MNaCL液反复洗涤细胞破碎液除去RNP,再以1MNaCL提取脱氧核糖蛋白,再按氯仿---异醇法除去蛋白.

两种方法比较,后种方法使核酸降解可能少一些.

以稀盐酸溶液提取DNA 时,加入适量去污剂,如SDS可有助于蛋白质与DNA 的分离。在提取过程中为抑制组织中的DNase对DNA 的降解作用,在氯化钠溶液中加入柠檬酸钠作为金属离子的烙合剂.通常用.15MNaCL,0.015M柠檬钠,并称SSC溶液,提取DNA.

(2).阴离子去污剂法:

用SDS或二甲苯酸钠等去污剂使蛋白质变性,可以直接从生物材料中提取DNA .由于细胞中DNA与蛋白质之间常借静电引力或配位键结合,因为阴离子去污剂能够破坏这种价键,所以常用阴离子去污剂提取DNA.

(3).苯酚抽提法:

苯酚作为蛋白变性剂,同时抑制了DNase的降解作用.用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA 联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。蛋白分子溶于酚相,而DNA溶于水相。离心分层后取出水层,多次重复操作,再合并含DNA 的水相,利用核酸不溶于醇的性质,用乙醇沉淀DNA 。此时DNA是十分粘稠的物质,可用玻璃漫漫绕成一团,取出。此法的特点是使提取的DNA保持天然状态 .

( 4).水抽提法:

利用核酸溶解于水的性质,将组织细胞破碎后,用低盐溶液除去RNA,然后将沉淀溶于水中,使DNA充分溶解于水中,离心后收集上清液.在上清中加入固体氯化钠调节至2.6M.加入2倍体积95%乙醇,立即用搅拌法搅出.然后分别用66% ٠80%和95%乙醇以及丙铜洗涤,最后在空气中干燥,既得DNA样品.此法提取的DNA中蛋白质含量较高,故一般不用.为除蛋白可将此法加以改良,在提取过程中加入SDS.

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