序列感作用(序列的概念)
序列的概念
序列生物即生命科学以序列为基础。
这是新时代的生命科学区别于以前的生物学的最主要的特点。随着人类基因组序列图的最终完成,SNP(单核苷酸多态性,即序列差异)的发现以及比较基因组学古代DNA、“食物基因组计划”、“病原与环境基因组计划”(主要是致命致病学)以及与之有关的人类易感性有关序列的推进,有科学、经济、医学意义的主要物种的基因组序列图都将问世。我们从序列中得到的信息,已经比到现在为止的所有生物研究积累的信息还要多。生物学第一次成为以数据(具体的序列数据)为根据与导向,而不是再以假说与概念为导向的科学。
python序列的概念
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序列的概念和分类
所谓同源序列,简单地说,是指从某一共同祖先经趋异进化而形成的不同序列。必须指出,相似性(similarity)和同源性(homology)是两个完全不同的概念。相似性是指序列比对过程中用来描述检测序列和目标序列之间相同DNA碱基或氨基酸残基顺序所占比例的高低。
同源序列的概念
高度同源的意思是:二者的来源源头是一样的,相似度很高。
高度同源也可以指同源基因。同源基因是分别在两条同源染色体或者两个姐妹染色单体上控制统一性状的一对基因。
同源性高,说明序列水平的差异比较小。共线性差,说明染色体结构差异比较大。
序列的基本概念
几何序列可分为Ⅰ型几何序列和Ⅱ型几何序列,Ⅱ型几何序列可以看做Ⅰ型几何序列的特殊形式,也可以看作是它的推广形式。Richard Games采用了一种全新的思想理解m序列的周期互相关函数,Klapper、Chan和Goresky在Games的基础上研究了一类称为几何序列的自相关和互相关函数。Ⅱ型几何序列可以看做Ⅰ型几何序列的特殊形式,也可以看作是它的推广形式。
中文名
几何序列
外文名
geometrique(suite)
所属学科
数学
分类
Ⅰ型几何序列和Ⅱ型几何序列
Ⅰ型几何序列Ⅱ型几何序列
基本介绍
Richard Games采用了一种全新的思想理解m序列的周期互相关函数。设GF(2)n是有限域GF(2)上的向量空间,PG(n-1,2)是GF(2)n上的有限射影几何。我们知道任意一个m序列都可以表示成
的形式,这里α是GF(2n)的本原元,
是GF(2n)到GF(2)上的迹函数,
。Games证明了m序列S和
上的超平面
是一一对应的。这样,Games把m序列看成一个有限射影几何上的超平面,则m序列的周期互相关函数等价于超曲面的交点数,然后利用有限射影几何的理论计算出了一些m序列的周期互相关函数。
Klapper,Chan和Goresky在Games的基础上研究了一类称为几何序列的自相关和互相关函数。下面我们给出几何序列的定义[1]。
*几何序列还有一种定义:称环A的元素序列(un)是几何序列,如果存在A的元素a,使得对任一非零自然数n,有un=aun-1=un-1a. 在此条件下,对任一自然数n,有un=anb,其中b=u0,反之,如果ab=ba,则由前面关系定义的序列(un)是几何序列,它称为以a为公比、以b为首项的几何序列[2]。
Ⅰ型几何序列
定义 设n是正整数,q是素数p的方幂,α是有限域
的本原元,
为q元m序列,f是从GF(q)到GF(2)的任意非线性函数,称序列
为Ⅰ型几何序列。
定义2 设
是有限域
的两个本原元,
f,g是从GF(q)到GF(2)的任意非线性函数,
和
是两个Ⅰ型几何序列。若是
则称序列T和序列S是线性相关的;若
称序列T和序列S是二次相关的。
Klapper等人给出了线性相关和二次相关的Ⅰ型几何序列的互相关函数。但是它们只是下面要介绍的Ⅱ型几何序列的特例,所以这里省略。
Ⅱ型几何序列
下面我们研究另外一种形式的几何序列,它既可以看作是定义1中几何序列的特殊形式,也可以看作是它的推广形式。
定义3 设q是素数p的幂,m|n,α是
的本原元,
是有限域GF(q)上的GMW序列,f是GF(q)到GF(2)的任意非线性函数,称
为Ⅱ型几何序列,其中
特别地,当r=l时,由于
,所以S就退化为Ⅰ型几何序列;在Ⅰ型几何序列中,若取
,就是Ⅱ型几何序列[1]。
空间序列的概念
空间序列的全过程,包含的步骤是。空间序列的排列和空间序列的组合