宏基因组测序的作用(宏基因组测序概念)

宏基因组测序概念

mngs是宏基因组测序的缩写

宏基因组测序意义

在生物学里，宏基因组一般指metagenomics，是某一个研究对象中所有的基因组的总和。相对应的，是个体的基因组。

举例来说，人的粪便，其中有很多种细菌，大肠杆菌、阴沟肠杆菌什么的。一份粪便样本，提取全部的DNA并研究，这就是宏基因组的思路。全部的DNA包括里边所有的细菌的，还包括排出这个粪便的个体的（人）。相对常用的概念指的是里边的全部微生物的DNA，不考虑人的。这个概念是将样本中的所有微生物看做一个整体，好处是不用分离每一种菌来研究，缺点是不知道哪个基因来自哪个菌。尤其是一些质粒片段。

宏基因组测序的原理

宏基因组是对程序进行分类，高通组是对程序进行优化

宏基因组是几代测序

全基因组测序是对未知基因组序列的物种进行个体的基因组测序。

而宏基因组也称微生物环境基因组，是指生境中全部微小生物遗传物质的总和。它包含了可培养的和未可培养的微生物的基因，目前主要指环境样品中的细菌和真菌的基因组总和。而所谓宏基因组学 (或元基因组学， metagenomics) 就是一种以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象。

两者为生物不同概念测序方法，所指含义不同，意义也不一样。

宏基因组测序报告解读

宏基因组学研究的对象是特定环境中的总DNA，不是某特定的微生物或其细胞中的总DNA，不需要对微生物进行分离培养和纯化，这对我们认识和利用95%以上的未培养微生物提供了一条新的途径。已有研究表明，利用宏基因组学对人体口腔微生物区系进行研究，发现了50多种新的细菌，这些未培养细菌很可能与口腔疾病有关。此外，在土壤、海洋和一些极端环境中也发现了许多新的微生物种群和新的基因或基因簇，通过克隆和筛选，获得了新的生理活性物质，包括抗生素、酶以及新的药物等。

宏基因组测序和全基因组测序

肿瘤基因检测，是针对引起肿瘤的致病突变进行的检测。根据检测目的主要分为两类：指导肿瘤患者的精准治疗，评估肿瘤患者的亲属罹患肿瘤的易感性。

肿瘤的本质是体细胞突变累积的结果。通过二代测序技术检测患者的肿瘤组织中含有哪些突变，确认引起在肿瘤发生过程中发挥驱动作用的突变，就可以针对性使用靶向药物。靶向药物相比传统化疗药物具有针对性强，副作用小的优点，可有效改善肿瘤患者的预后。靶向药物在肺癌治疗中的应用经验最丰富。目前有条件的肺癌患者需要常规进行基因检测，有助于临床医生选择个体化的医疗方案。

有一些肿瘤的遗传性很强，比如卵巢癌，乳腺癌，结直肠癌等。这意味着肿瘤患者的亲属也有可能发生肿瘤。最著名的例子是安吉丽娜朱莉，她的妈妈和姨妈都患有乳腺癌，提示她的家族可能存在乳腺癌致病基因。为了确认自己是否携带相关致病基因，她进行了BRCA基因检测，发现自己果然携带这个BRCA1基因突变。

携带这种基因突变并不意味着一定发生肿瘤，但是肿瘤发生的风险要远高于一般人。因此她先后切除了乳腺和卵巢，预防乳腺癌和卵巢癌的发生。需要注意的是，进行这种基因检测，使用的是血液样本。

以上只是简单介绍了肿瘤基因检测的两个最主要目的。实际上根据不同的检测技术和检测样本，肿瘤基因检测还可以实现肿瘤早期筛查和诊断，肿瘤动态检测，肿瘤患者预后等多种目的。肿瘤基因检测专业性较强，需要配套相应的遗传咨询，与临床，实验室，患者三方面充分沟通，才能全面发挥肿瘤基因检测的重要作用。

宏基因组测序定义

是微生物环境基因组学、元基因组学。它通过直接从环境样品中提取全部微生物的DNA,构建宏基因组文库，利用基因组学的研究策略研究环境样品所包含的全部微生物的遗传组成及其群落功能。

宏基因组测序专家共识

予果生物科技有限公司是中国最早深耕于病原感染诊断的企业之一，也是科技部十三五国家重点研发项目中唯一的病原宏基因组测序企业。

北京总部研发中心近4000平米；在西安建立了西北地区最大的测序中心，P2级别生物安全实验室具备临床基因扩增检验资质；在北京、广州、上海、南京运营基因测序实验室和GMP厂房；并于2020年5月获授牌“北京国家新一代人工智能创新发展试验区-智能测序场景开放实验室”，与高校建立泛基因组联合实验室，建有国内最大的病原基因组和泛基因组数据库，与上海市实验医学研究院合作共建，助力我国实验医学在人类重大疾病、传染病和疑难病的病原精准诊断。

予果生物与临床医疗专家、检验科专家、耐药基因研究专家建立深度合作，已为全国超过400余家三甲医院提供临床检测、筛查、咨询服务。累计完成近5万例样本的检测，样本总数位居全球前列，其中脑脊液检测量位列全球第一。