lncrna作用的方式(lncRNA机制)

lncRNA机制

在小RNA领域MRE一般是miRNA Response Elements 的缩写, 这句话是说lncRNA上存在MREs, 并在癌症的转录后调控阶段有重要作用;遇到这种简写去google搜比较好，英文版生化，分子，细胞的教科书index部分一般会有很多简写的全称

lncRNA干扰

人类遗传资源是可单独或联合用于识别人体特征的遗传材料或信息，是开展生命科学研究的重要物质和信息基础，是认知和掌握疾病的发生、发展和分布规律的基础资料，是推动疾病预防、干预和控制策略开发的重要保障，已成为公众健康和生命安全的战略性、公益性、基础性资源。

包括以下数据：

（1）临床数据，如人口学信息、一般实验室检查信息，CRF数据等；

（2）影像数据，如B超、CT、PET-CT、核磁共振、X射线等；

（3）生物标志物数据，如诊断性生物标志物、监测性生物标志物、药效学/反应生物标志物、预测性生物标志物、预后生物标志物、安全性生物标志物、易感性/风险生物标志物；

（4）基因数据，如全基因组测序、外显子组测序、目标区域测序、人线粒体测序、全基因组甲基化及其它表观遗传修饰测序、lncRNA测序、转录组测序、单细胞转录组测序、smallRNA测序等；

（5）蛋白质组数据；

（6）代谢组学数据。

lncrna综述

生物体中的RNA种类繁多，功能复杂，一般按照是否编码蛋白质将其分为编码RNA（coding RNA）和非编码RNA（non-coding RNA, ncRNA）两大类。前者就是指mRNA，后者则包括很多种类，如众所周知的tRNA和rRNA，参与mRNA剪接的snRNA，参与RNA修饰的snoRNA等。

非编码RNA种类很多，按照长度可分为两大类：大于200 nt（核苷酸）的称为长非编码RNA（lncRNA），小于200 nt的称为小非编码RNA（small ncRNA），50 nt以下的还可称为tiny ncRNA，如siRNA、miRNA和piRNA等。

lncRNA特点

长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是长度大于 200 个核苷酸的非编码 RNA。研究表明, lncRNA 在剂量补偿效应(Dosage compensationeffect)、表观遗传调控、细胞周期调控和细胞分化调控等众多生命活动中发挥重要作用，成为遗传学研究

lncRNA是如何产生的

生物医学数据的类型

(1)组学数据：包含基因组、转录组、蛋白质组、代谢组、甲基化组、微生物组、相互作用组等。以人为例，成年人的体细胞数量约有1013个，其中绝对大数细胞都含有一套基因组，即30亿个碱基对。

在各种时、空、条件下，不同时间(如发育阶段，昼夜节律)、不同空间（不同组织/器官）以及不同条件（如疾病/健康，锻炼前后，不同饮食，不同气候等）基因转录组、蛋白组、代谢组、甲基化组。

最近，人们逐渐发现，人体实际是一个复杂的生态细胞，居住在人体的微生物数量甚至10倍于人的体细胞数量，据估计成年人肠道微生物的重量就有3-5公斤重，并且这些微生物每个又都有基因组、转录组、蛋白质组和代谢组等。

此外，“一花一世界，一叶一菩提”，世间万物都没有孤立的，而是有千丝万缕的联系和相互作用，因此就有各种各样的相互作用组和网络，如蛋白相互作用网络、细胞信号传导网络、基因调控网络、代谢网络、遗传相互作用网络、人脑连接网络等。

(2)药物、毒性物质数据：一些对人类健康与疾病有重大作用的因子，如药物、毒性物质、营养、生活方式、化学小分子等数据积累亦越来越多。以药物为例，其结构、药理、靶点、作用机制和通路、副作用等数据亦有大量积累。

(3)疾病数据：包括症状、疾病关联、相关基因（蛋白、miRNA、lncRNA、微生物）等数据。

(4) 电子病历数据。

(5) 影像数据。包括临床上人体X射线、CT、MRI、病理等数据，以及基础实验室动物、细胞的影像数据等。

(6)互联网数据。

(7) 可穿戴设备数据。

(8) 病人汇报数据。

lncrna机制研究思路

1.引物应在核酸系列保守区内设计并具有特异性。2.扩增产物长度在 80-150bp。最长不要超过 300bp。3.产物不能形成二级结构(自由能小于 58.61KJ/mol)。4.引物长度:一般在 17-25 碱基之间,上下游引物不宜相差太大。5.引物自身不能有连续 4 个碱基的互补,避免形成发卡结构。

lncRNA调控

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